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小米手机短信是可以加密的，具体设置步骤如下。
1、打开手机，找到“设置”选项并点击进入，在设置菜单中找到并点击“应用锁”选项，进入应用锁界面后可看到手机中已安装的应用列表，找到“短信”应用并将其右侧的开关开启，即可对短信进行加密。
2、在手机应用商店中下载并安装相关的隐私保护软件，如“隐私空间”、“信息加密”等软件，安装完成后根据软件的指引设置密码，然后将短信添加到软件中并进行加密处理。
还可以使用MIUI系统的短信智能识别功能对私密短信进行加密，具体操作是进入短信界面，长按需要加密的短信，然后点击右下角的“更多”按钮，选择“设为私密”即可，要查看已加密的短信，可以在短信列表中点击右上角“私密短信”按钮进行查看。
方法供参考，可以根据个人需求和手机版本选择适合的加密方式，如仍有疑问，建议咨询小米官方客服或前往小米专卖店获取更多帮助。